Verdedigingslinies
Met de aanleg van het Pannerdensch Kanaal werd het mogelijk bestaande verdedigingslinies te versterken en nieuwe te creëren. De Grebbelinie en de Liniedijk Ochten-Spees kwamen tot stand. Er kon nu volop water uit de Neder-Rijn en Lek worden getapt voor strategische inundaties (het onder water zetten van land).
In de 19e eeuw werd de Nieuwe Hollandse Waterlinie gerealiseerd, een ingenieus systeem van waterwegen, inundatiekanalen, sluizen en forten. Het Pannerdensch Kanaal, de Neder-Rijn en Lek voorzagen de linie van water. Volledige inundatie van de linie kostte echter drie weken. Het was daarom belangrijk om de watertoevoer naar de Nieuwe Hollandse Waterlinie goed te bewaken. Daarvoor werd op het splitsingspunt bij Pannerden het (bijna) onneembare Fort Pannerden gebouwd.
Fort Pannerden, gelegen in de Klompenwaard
Tijdens de Koude Oorlog was het Pannerdensch Kanaal van vitaal belang voor de Rijn-IJssellinie. Het plan voor deze linie hield in dat de Waal ten oosten van Nijmegen en de Neder-Rijn voorbij het splitsingspunt onder Arnhem zouden worden afgesloten. Er lagen daartoe drijvende stalen constructies gereed ter lengte van de breedte van de desbetreffende rivier, die als één geheel op een vernuftige wijze verticaal konden worden afgezonken. Al het water uit de Boven-Rijn zou naar de IJssel worden geleid waardoor die ver buiten zijn oevers zou treden. De enorme watervlakte tussen Nijmegen en Kampen moest het westen en midden van het land beschermen tegen de invasie van een Russisch tankleger.