Waterkwaliteit
In de tweede helft van de vorige eeuw is de waterkwaliteit van de Rijn flink verslechterd door lozingen van de industrie stroomopwaarts. Sinds de jaren tachtig wordt er hard aan verbetering gewerkt en de waterkwaliteit neemt langzamerhand weer toe. Om de waterkwaliteit in heel Europa verder te verbeteren is sinds eind 2000 de Europese Kaderrichtlijn Water van kracht. Die moet ervoor zorgen dat de kwaliteit van het oppervlakte- en grondwater in Europa in 2015 op orde is. Lees meer
Dit geldt dus ook voor het Pannerdensch Kanaal. Hoewel het kanaal niet erg lang is, is een goede waterkwaliteit ook voor het Pannerdensch Kanaal van groot belang. Bij hoog water stroomt het water uit het kanaal de uiterwaarden in. Als het water sterk vervuild is, heeft dat een negatieve invloed op de dier- en plantensoorten in de uiterwaarden.
Maar ook de landbouw heeft baat bij een goede waterkwaliteit. Vanuit het Pannerdensch Kanaal wordt water in de Linge gelaten. Fruittelers in de Betuwe gebruiken dit water voor besproeiing van hun fruitbomen. In het vroege voorjaar is dit geregeld nodig als er nog nachtvorst is en de bomen in bloei staan. Door de bomen te besproeien komt er een dun ijslaagje rond de bloemen, die de bloesem beschermt tegen de vorst. Als het water erg vervuild is, komt dat vervolgens in de bodem en dat kan de bomen aantasten.